Современная наука может объяснить различные явления, но только в рамках своего метода

Как это работает? Ученый берет факты, связывает их логической моделью, используя причинно-следственные связи, и на базе этой модели объясняет те или иные факты.
Например, наука уже дала объяснения многим явлениям, которые раньше вызывали у людей религиозный трепет. Как гром и молния, морские приливы и отливы, течения, судороги и галлюцинации у людей - это все когда-то считали происками бога или демонов.
При этом наука не стоит на месте: с каждым годом ученые открывают что-то новое, приоткрывая завесу тайн Вселенной.
Однако современная наука может объяснить далеко не все. Например, пока что наука не может на 100% понять работу человеческого мозга, наши эмоции и чувства или тайну зачатия у животных (почему именно конкретный сперматозоид участвует в оплодотворении и т.п.).
Таким образом, ответ на вопрос о том, все ли современная наука может объяснить, зависит от конкретного явления и его специфики. Короче, ничего конкретного, раз факты можно интерпретировать в угоду того или иного ученого, института и власти.